SNP Namea | SNP IDb | Chr12 Positionc | Location | Amino Acid Change | RegDB Scored | Major/Minor Alleles | MAF | GT | GT Count (Carrier Freq) | Adjusted Mean ± SD (mg/dL) | β | SE | R2 (%) | P | FDR | Second Assoc Trait (Effect) |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
HDL-C | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
 p52919 |  | 125296601 | Intron 4 |  | 5 | G/T | 0.0013 | GG | 734 | 47.87 ± 12.71 | −7.4063 | 2.5863 | 1.1050 | 0.0043 | 0.1465 | ApoA-I (↓) |
 |  |  |  |  |  |  |  | GT | 2 (0.27) | 24.67 ± 9.26 |  |  |  |  |  |  |
 p53372 | rs115604379 | 125296148 | Intron 5 |  | 5 | C/T | 0.0066 | CC | 729 | 47.68 ± 12.64 | 3.0372 | 1.1642 | 0.9140 | 0.0093 | 0.2190 |  |
 |  |  |  |  |  |  |  | CT | 10 (1.35) | 58.2 ± 13.03 |  |  |  |  |  |  |
 p54611 |  | 125294909 | Intron 5 |  | 4 | T/C | 0.0007 | TT | 742 | 47.86 ± 12.68 | −9.5243 | 3.6710 | 0.8920 | 0.0097 | 0.2190 | ApoA-I (↓) |
 |  |  |  |  |  |  |  | TC | 1 (0.13) | 19.59 ± NA |  |  |  |  |  |  |
 p54856 |  | 125294664 | Intron 6 |  | 4 | C/T | 0.0007 | CC | 742 | 47.85 ± 12.70 | −8.4305 | 3.6579 | 0.7130 | 0.0215 | 0.3243 | ApoA-I (↓) |
 |  |  |  |  |  |  |  | CT | 1 (0.13) | 21.48 ± NA |  |  |  |  |  |  |
 p77620 | rs377124254 | 125271900 | Intron 10 | 5 | G/A | 0.0007 | GG | 735 | 47.77 ± 12.67 | 11.5518 | 3.6514 | 1.3500 | 0.0016 | 0.1104 |  | |
 |  |  |  |  |  |  |  | GA | 1 (0.14) | 90.2 ± NA |  |  |  |  |  |  |
 p82264 | rs141545424 | 125267256 | Exon 12 | Gly501Gly | 5 | C/A | 0.0007 | CC | 739 | 47.77 ± 12.66 | 11.5850 | 3.6469 | 1.3530 | 0.0016 | 0.1104 |  |
 |  |  |  |  |  |  |  | CA | 1 (0.14) | 90.31 ± NA |  |  |  |  |  |  |
ApoA-I | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
 p52919 |  | 125296601 | Intron 4 |  | 5 | G/T | 0.0013 | GG | 741 | 136.81 ± 27.74 | −13.4137 | 6.4689 | 0.5750 | 0.0385 | 0.4359 | HDL-C (↓) |
 |  |  |  |  |  |  |  | GT | 2 (0.27) | 97.42 ± 18.38 |  |  |  |  |  |  |
 p54611 |  | 125294909 | Intron 5 |  | 4 | T/C | 0.0007 | TT | 748 | 136.83 ± 27.66 | −19.2831 | 9.0970 | 0.5980 | 0.0344 | 0.4359 | HDL-C (↓) |
 |  |  |  |  |  |  |  | TC | 1 (0.13) | 80.62 ± NA |  |  |  |  |  |  |
 p54856 |  | 125294664 | Intron 6 |  | 4 | C/T | 0.0007 | CC | 748 | 136.87 ± 27.61 | −24.0757 | 9.0781 | 0.9330 | 0.0082 | 0.2918 | HDL-C (↓) |
 |  |  |  |  |  |  |  | CT | 1 (0.13) | 67.98 ± NA |  |  |  |  |  |  |