Region # | Consecutive Haplotype Windows in 623 US Non-Hispanic Whitesa | Consecutive Haplotype Windows in 788 African Blacks | ||||||||||
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 | Trait | Chr12 Positionb (Location) | Length (bp) | The Composited Variants, 5′ to 3′ Direction | Trait | Chr12 Positionb (Location) | Length (bp) | The Composited Variants, 5′ to 3′ Direction | ||||
 |  | Start (5′) | End (3′) |  | SNP Namec-SNP IDd | Major/Minor Alleles |  | Start (5′) | End (3′) |  | SNP Namec-SNP IDd | Major/Minor Alleles |
I | ApoB | 125300551 | 125299369 | 1183 | p48969-rs2343394 | C/T | HDL-C | 125300551 | 125299496 | 1056 | p48969-rs2343394 | C/T |
 |  | (intron 2) | (intron 3) |  | p49518-rs144194221 | G/A |  | (intron 2) | (intron 3) |  | p49537-rs7305310 | C/T |
 |  |  |  |  | p49690-rs4765615 | A/G |  |  |  |  | p49570delC-rs145376237 | W/D |
 |  |  |  |  | p49978-rs5891 | G/A |  |  |  |  | p49690-rs4765615 | G/A |
(p.Val135Ile) | ||||||||||||
 |  |  |  |  | p50151-rs2278986 | T/C |  |  |  |  | p49759-rs146272788 | C/T |
 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | p49978-rs5891 | G/A |
(p.Val135Ile) | ||||||||||||
 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | p50024-rs368880622 | G/T |
 |  |  |  |  |  |  | ApoA-I | 125299830 | 125299369 | 462 | p49690-rs4765615 | G/A |
 |  |  |  |  |  |  |  | (intron 2) | (intron 3) |  | p49759-rs146272788 | C/T |
 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | p49978-rs5891 | G/A |
(p.Val135Ile) | ||||||||||||
 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | p50024-rs368880622 | G/T |
 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | p50118-rs58710319 | C/T |
 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | p50151-rs2278986 | T/C |
II | HDL-C | 125269692 | 125262516 | 7177 | p79828-rs838895 | C/G | HDL-C | 125269692 | 125267501 | 2192 | p79828-rs838895 | C/G |
 |  | (intron 11) | (exon 13- 3′ UTR) |  | p80045-rs838893 | G/A |  | (intron 11) | (intron 11) |  | p80045-rs838893 | G/A |
 |  |  |  |  | p83088-rs797729 | A/G |  |  |  |  | p81863-rs185445624 | G/A |
 |  |  |  |  | p83884-rs701106 | C/T |  |  |  |  | p82019-rs838890 | C/T |
 |  |  |  |  | p86436-rs10396214 | C/T | HDL-C | 125267501 | 125267086 | 416 | p82019-rs838890 | C/T |
(p.Arg484Trp, isoform 2) | ||||||||||||
 |  |  |  |  | p87004-rs184715678 | C/A |  | (intron 11) | (intron 12) |  | p82264-rs141545424 | C/A |
(p.Gly501Gly) | ||||||||||||
 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | p82340-rs77483223 | G/A |
 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | p82369-rs75446635 | G/A |
 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | p82434-rs838889 | T/C |
 |  |  |  |  |  |  | HDL-C | 125265636 | 125262553 | 3084 | p83884-rs701106 | C/T |
 |  |  |  |  |  |  |  | (intron 12) | (exon 13- 3′ UTR) |  | p86245-rs188375019 | C/T |
 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | p86276-rs747155 | C/T |
 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | p86316-rs701104 | G/T |
 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | p86481-rs701103 | G/A |
(p.Gly499Arg, isoform 2) | ||||||||||||
 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | p86967-rs187492239 | A/G |